Seis anos mais tarde, isto é, no ano de 1522, concretamente no dia 26 de Janeiro, chega às costas de Timor a nau "Vitória". Comandada por Juan Sebastian del Cano e tripulada por 46 espanhóis e 13 nativos, e embarcados durante a viagem ao largo de Amabau (?). A descrição da estadia nas povoações costeiras de Timor foi feita por António Pigafetta, cronista (cf Gunn, op. cit., p.60). Estiveram lá 18 dias. Pigafetta anota a existência da doença venérea "sífilis" (maladie portugaise) ou doença S. Job. Sobre os contactos mantido entre os espanhóis e timorenses, em 1522, diz o cronista, Pigafetta:
"No sábado, 25 de Janeiro de mil quinhentos e vinte e dois, partimos da ilha de Mallua (Allor). E no Domingo seguinte chegámos a uma grande ilha a cinco léguas de distância da outra, entre sul e sudoeste. E eu fui à terra sozinho, para falar com o chefe de uma terra chamada Amabau, para ver se ele nos podia fornecer mantimentos. Respondeu que nos daria bois, porcos e cabras; mas não conseguimos entrar em acordo porque ele queria, em troca de um boi, demasiadas coisas das quais tínhamos pequena quantidade. Assim, com a fome a pressionar-nos, retivemos no nosso barco, juntamente com o seu filho, um dos homens importantes de outra cidade chamada Balibó. E, com o medo de que o matássemos, deram seis bois, cinco cabras e dois porcos e, para completar o número de dez porcos e dez cabras, deram-nos um boi, dado ter sido este o resgate que pedimos para eles. Mandámo-los então para terra e forma muito contentes porque lhes demos linho, tecidos de seda e de algodão, facas, espelhos e outras coisas" (in Gunn, p.60).
Sobre o povo de Timor, sua forma de governação e o ainda existente mito do seu ouro, Pigafetta, prossegue:
"Esse senhor de Amabau, com quem falei, tinha só mulheres ao seu serviço, Andam, como as outras, todas nuas e usam nas orelhas pequenas argolas de ouro pendurado por fios de seda, e nos braços, até aos cotovelos, muitas pulseiras de ouro e algodão. E os homens andam como as mulheres, mas suam, ao pescoço, certas argolas de ouro arredondadas e de tamanho de um trincho, e usam, no penteado, pentes de bambu enfeitados a ouro. Alguns usam também outros ornamentos de ouro…Do outro lado da ilha estão quatro irmãos, os seus reis. E onde estivemos só há cidades e alguns chefes e senhores destas. Os nomes das habitações dos quatro reis são: Oibich (Oebico), Lichsana, Suai, Cabanasa. Oebich é a cidade maior. Em Cabanaza (segundo nos disseram) há ouro numa montanha e eles compram tudo com um certo tipo de pequenas peças que têm". (Gunn, p.61). (…) " A ilha é toda habitada e é muito comprida no sentido este-oeste, de norte a sul, não muito larga. Situa-se a dez graus de latitude na direcção do pólo Árctico e, em longitude, a cento e sessenta e quatro graus e meio da linha de separação, e chama-se Timor".
No entanto, até meados do século XVII, não ouvimos falar de estabelecimentos de feitorias portuguesas ou entrepostos comerciais.
Quando se fala da missionação de Timor e ilhas circunvizinhas, costuma-se citar o nome do padre Frei António Taveira, dominicano, que no ano de 1556, teriam baptizado cinco mil pessoas nas ilhas de Timor e Ende (Flores). Desde 1561, altura em que se estabeleceram os Frades Dominicanos em Solor, até 1702, Timor, Solor e outras ilhas foram "governadas"por frades dominicanos. O segundo missionário que esteve em Mena, foi o padre Frei Belchior da Luz ou das Antas. Em 1633, aparece na costa norte, no reino de Silawan, hoje a dois quilómetros de Batugade, o padre Frei Cristóvão Rangel que converteu o régulo, e construiu ali uma igreja e uma capela.
Até 1613, os Portugueses contentaram-se com a sua base na Ilha de Solor como ponto de recolha para produtos vindos de Timor, e ocupavam um pequeno forte em Kupang, no Timor ocidental. A 20 de Abril de 1613, os Holandeses conquistam Solor, e dali enviam as suas naus para se apoderarem das povoações costeiras de Timor, sobretudo na parte ocidental. Com a presença permanente da Companhia das Índia orientais, os holandeses firmam diversos acordos com os chefes locais, que entram em contínuos conflitos com os Portugueses. Entretanto, em 1627, as funções de governador de Solor foram assumidos por Jan d’Hornay, protegidos de holandeses. Por causa das divergências, Jan d’Hornay, converte-se ao catolicismo e alia-se aos Portugueses. Ele seria o chefe de uma numeroso clã que juntamente com o de Mateus da costa iria, dominar a cena política e social de Timor ao na segunda metade do século XVII, e na segunda metade do século XVII.
Em 1640, deu-se a invasão de Timor por uma poderosa armada de Karrilikio (Camiliquio) sultão de (Tolo) Tallo, em Sulawesi (Celebes). Avançou sobre Timor atacando as costas norte e sul com uma frota de 150 "perahu" (barcos à vela) e 700 homens e procurou os nativos a levantarem-se contra os Portugueses. Após três meses de devastação ao longo do litoral de Timor e alguns êxitos na conversão de alguns chefes timorenses, Karrlikio retira-se. No entanto, a sua acção obrigou os Portugueses então residentes em Larantuca, na ponta oriental da ilha de Flores, a transferir as suas actividades para Timor.
É neste contexto que entra em cena um dos grandes apóstolos de Timor, o padre Frei António de São Jacinto, dominicano e vigário-geral de Solor. Acompanhado de 70 soldados, partiu de Larantuca para Mena, encontrou-a destruída e o seu chefe morto. A rainha viúva, devido à invasão muçulmana, foge para o interior, a cerca de 12 léguas de distância. Depois de ter sido auxiliada pelo padre Frei António de S. jacinto, a rainha converte-se e regressa a Mena. A partir daqui, sobe de intensidade a influencia do dominicano junto dos régulos. Movidos pelo exemplo e palavras de António de S. Jacinto, convertem-se os régulos ou chefes de Lifau, Oe-Cusse, Amanuban e Kupang. Por causa da influência dos muçulmanos de Celebes junto de alguns chefes timores, os portugueses organizam uma expedição contra o Reino de Behale que foi destruído. Comandada por Francisco Fernandes, esta operação tomou a forma de quatro desembarques de dois corpos de tropas, realizados a 26 de Maio de 1641 e envolveu, ao todo, 90 soldados e frades dominicanos. A vitória sobre Behale ou Wehale, em 1642, trouxe a conversão de vários reis, e a consolidação da soberania portuguesa na parte leste, conhecida pelo nome Província dos Belos. Os reinos que abraçavam a fé, juravam também lealdade à Coroa de Portugal. Além disso tinham de pagar ao superior da missão dominicana certos artigos, como tributo, bem como de fornecer efectivos humanos em caso da ameaça da parte dos holandeses ou régulos rivais.
Os Holandeses: Com a tomada de Malaca em 1642, os holandeses começam a marcar sua presença no Arquipélago indonésio. Em 27 de Janeiro de 1562, sob o comando do general Arnold de Vlamingh von Outshroom, uma armada de holandeses desembarcam na baía de Kupang e avançam sobre a povoação de Amarasi. Mas Arnold van Vlaming foi derrotado e retirou-se para Solor. Em 1660, os holandeses com uma esquadra de 26 barcos fizeram uma malograda tentativa para destruir Larantuca. Foi para reagir a este constante assédio dos holandeses que o Vice-Rei António Melo de Castro, decidiu em 1665 criar o posto de capitão-mor de Timor, para coordenar a luta contra os holandeses. O primeiro a ocupar esse cargo foi Simão Luís.
A 6 de Agosto de 1661, A Holanda e Portugal assinaram um acordo de paz. Segundo esse acordo, ficava determinado que cada potência reservaria para si os territórios já ocupados em Solor e Timor. Os Holandeses conservavam Kupang, mas com a obrigação de fornecer duas corvetas armadas para o serviço do governador português, uma para transportar os impostos colectados em Timor, e outra para defender a costa contra os ataques de Macáçar. (Gunn, p. 85).
Lifau, Foi neste período, que, uma vez perdidas Macaçar e Kupang os Portugueses, sobretudo os mercadores de sândalo, começaram a frequentar a povoação costeira de Lifau. Vários foram os pedidos ao Governo central de Lisboa para se estabelecer estruturas permanentes de governo em Timor. A partir de 1695, o Vice-rei do estado da Índia começou a fazer tentativas de colocar em Lifau um governador. Assim o primeiro governador a ir para Timor foi António de Mesquita Pimentel, mas infelizmente foi expulso por Domingos da Costa. O seu sucessor André Coelho Vieira foi preso por Domingos da Costa e reenviado para Macau. Por volta de 1697 Lifau já se podia considerar a capital de Solor e Timor. Segundo William Dampier que visitou Lifau no decurso da sua estadia de três meses em Timor, verificou que na povoação estava firmemente estabelecida uma comunidade com estruturas básicas. Dampier encontrou em Lifau três portugueses, dos quais dois eram padres. A população era constituída na sua generalidade por mestiços portugueses e alguns residentes chineses que traficavam cera, ouro, escravos, e sândalo em troca de arroz, porcelana e certos produtos europeus importados anualmente de Macau numa frota de 20 navios. Em termos de governo, observou Dampier, a verdadeira autoridade pertencia ao capitão-mor, um homem chamado António Henriques, um português enviado pelo Vice-rei de Goa. (cf Gunn, pp.86-87).
A partir 20 de Fevereiro de 1702, a praça de Lifau passou a ser governada com mais rigor, como sede de governo português em Timor. O primeiro a desempenhar as funções de governador e capitão general das Ilhas de Timor e Solor, foi António Coelho Guerreiro( 1702-1705). Este governador deixou-nos o primeiro mapa de Lifau. Datada de 1702, revela uma estrutura urbana razoavelmente complexa, com elementos militares, civis e eclesiásticos, incluindo a Ermida de Santo António e um hospital. Quando foi nomeado, António Coelho Guerreiro tinha a obrigação de neutralizar o domínio holandês e chinês sobre o sândalo e de tomar posição firme contra a rebelião do Clã dos Costas. O governador empenhou-se em equilibrar o poder dos régulos timorenses, conferindo a categoria de "datos", ou de ‘coronel’. Por causa de várias circunstâncias adversas, António Coelho Guerreiro acabou por abandonar o cargo e partiu descontente para Goa. A seguir, foram nomeados governadores de Timor e Solor: Jácome de Morais (1708-1709), Manuel de Sotto Mayor (1709-1713), Manuel Ferreira de Almeida (1713-1718), Francisco de Mello e Castro (1718-1720 e António de Albuquerque Coelho (1722-1725). O governo interino do Bispo Frei Manuel de Santo António (vários frades dominicanos, como governadores interinos).
Timor foi nesse período de contínuas revoltas e sublevações. O caso dos topasses.
Em 1719, deu-se a primeira grande sublevação, mais conhecida pela "Rebelião de Cailaco". Na sequência de diversos actos de revoltas, que incluíram o assassinato de dois missionários dominicanos e a profanação de igrejas, vários chefes dos reinos da região centro e ocidental (Lamaquitos e outros) aliaram-se ao rei de Camanasa para expulsarem de Timor os Portugueses e os cristãos. Para esse fim celebraram um pacto de sangue de acordo com os ritos locais. O pacto consistia num juramento de lealdade entres participantes acompanhado pelo sacrifício ritual de um galo e de um cão e pela ingestão do respectivo sangue. Iniciou-se a rebelião contra os Portugueses e durou 50 anos. Em 1722, deu-se a guerra de Luca. As causas: rejeição de pagamento de fintas (impostos). Era uma espécie de tributo pagável pelos reinos considerados leais. As fintas incluíam sândalo, óleo, trigo ou qualquer produto exportável. A primeira codificação do sistema foi estabelecido pelo governador António Moniz de Macedo (1725-29; 1734-39), contemplava ambos os por sexos e abrangia reinos e sucos. Liderado por Camanasa, os reinos de Lemac Hitu, Cailaco, Leo-Hitu, Sani, Atsabe, Leimean, Diribate e Hermera. Uniram-se O governador António Moniz de Macedo procedeu o castigo dos rebeldes e encarregou o capitão-mor da província, Gonçalo de Magalhães de atacar os redutos dos reinos rebeldes. Foi então decidido atacar Cailaco, considerado o quartel-general dos rebeldes.
Em 1769, deu-se o cerco da Praça de Lifau. Em 1766, deu-se o envenenamento do governador Dionísio Galvão Rebelo (1760-1766) por Francisco Hornay, António da Costa, Quintino da Conceição e Lourenço de Mello. Foram entretanto nomeados governadores interinos, frei António de S. Boaventura e o régulo José Rodrigues Pereira. Francisco de Hornay maquina tomar o lugar de governador. Entretanto chega o novo governador, António José Teles de Meneses ( 1768-1775). Entretanto dificuldades de toda a ordem (falta de alimentos, comunicações com o interior cortadas, a praça cercada por topases de Francisco Hornay), decide o governador abandonar Lifau., no dia 11 de Agosto de 1769. Depois de ter embarcado a população (cerca de 1200 pessoas, na sua maioria mulheres e crianças) os navios São Vicente, e de Santa Rosa, que haviam chegado de Macau, e de ter carregados bagagens e material de guerra, António Teles de Meneses toma o rumo do oriente indo estabelecer a nova sede do governo na praça de Díli, aonde chegaram a 10 de Outubro desse mesmo ano.
A localização de Díli numa planície aberta oferecia uma defesa natural e era rica para cultivo de arroz. Entretanto, Lifau e os reinos circunvizinhos ficaram em poder de Francisco Hornay, e o comércio do sândalo na mão dos chineses. Depois de ter estabelecido a nova capital na praça de Díli, e de ali ter hasteado a bandeira, cerca de 42 reis da Província dos Belos deslocaram à Praça para jurara a lealdade a Portugal. Nos anos sucessivos todos os reinos se mantiveram em paz, à excepção de Luca onde deflagrou um revolta chamada a "guerra dos loucos"ou dos doidos. (1781-178). Assim chamada porque a revolta tinha sido chefiada por um pretenso profeta que se julgava invulnerável. Esse homem comandando ‘gente rude, ignorante e supersticiosa, no dizer do governador Afonso de Castro, marchou sobre Díli. A rebelião foi esmagada pelo governador João Baptista Vieira Godinho (1785-1788).
Até a fim do século registaram-se várias revoltas, praticamente em todos os reinos dos Belos. Em 1778, houve rebeliões nos reinos de Belu e Manatuto. Em 1790, nos reinos de Maubara e Senobai. No reino de Manatuto, muitos liurais (Dom Matias Soares, Boaventura Soares Doutel e Francisco Soares Doutel) e cristãos aliaram-se ao Governador do Bispado, contra o governador. António Feliciano Nogueira Lisboa (1788-1790).
Por alturas do novo século, a administração estava fracionada entre o liurai de Motael, cujo reino se tornara uma poderosa independente e a Igreja, com a sede em Manatuto. Em 1881, havia 23 reinos fiéis a Portugal e que eram considerados tributários. E outros 18 reinos aliados. Para impedir os ataques de franceses, ingleses e holandeses e dos topases, o governador João Baptista Vesquain mandou construir uma fortaleza em Díli. Formaram-se os moradores, isto é forças civis militarizadas, os de Bidau (naturais de Solor) e Sicas, naturais de Flores (Sicca).Havia um corpo de soldados de regulares, constituído por europeus e cipaios provenientes de Goa.
O desenvolvimento do comércio (cf. Gunn. P.122-124): na primeira metade do século XIX, registava-se a presença de uma comunidade chinesa em Díli e isso deveu-se ao comércio do sândalo em vários pontos da ilha. Durante a visita de F.E. de Rosely a Díli, observou no porto de Díli dois navios portugueses de Macau, cada um deles de 300 toneladas. Chegaram em Março e regressaram em finais de Junho com uma carga de sândalo, mel e alguns escravos. Além de comerciantes de Macau, havia os macáçares que faziam de intermediários entre Timor e Macau. Produtos procurados de Timor: além do sândalo, exportava canela vendida para Goa, couros, cobre, cachalotes, bambu, tabaco, mel, sal búfalos e cavalos. Crawfurd, escrevendo em 1820 três produtos Principais de exportação; SANDALO, CERA E BALEIA. (p.126-128)
A primeira plantação de café foi feita em 1815, no tempo do governador José Pinto Alcoforado de Azevedo e Sousa (1815-1819). Foi ele quem enviou 20 homens numa expedição em busca do petróleo nos reinos de Bibicussu, Samoro, Turiscai e Tutuluro. Por volta de 1858, o café figurava já nas estatísticas das exportações como tendo um elevado volume de produção e um elevado valor comercial, ao lado das exportações mais tradicionais, como cera, mel, couros, trigo, sândalo tartarugas, cavalos. Nessa altura parou a exportação de escravos (Gunn, p.147). Em 1867, a economia de café, em Timor começou a crescer de "um modo extraordinário", como se dizia num relatório oficial. No mês de Setembro desse ano, cinco navios holandeses e um inglês (ou seja, um total de 661 toneladas) chegaram a Díli provenientes de Kupang, Melbourne, Amboina e Macáçar, para carregar café e sândalo. No ano económico de 1858 a 59, exportaram-se 19 toneladas de café. No ano de 1860, 61 toneladas e em 1865, 145 toneladas.
O seu sucessor, Manuel Joaquim de Matos Góis (1831-1832) contratou um perito para pesquisar ouro, cobre, enxofre e outros recursos minerais.
Na década dos anos 30 do século XIX, surgem de novo os conflitos. Primeiro a nível do governo. Com a morte do Governador Miguel de Silveira Lorena, em 1832, a governação foi confiada a título interino, ao Padre Vicente Ferreira Varela, que em conflito com dois outros membros da junta, os mandou prender e tomou conta do governo até a chegada do novo governador José Maria Marques. Em Lauterm (Sama) registou-se ouve um conflito entre 70 buguises (macaçares) e as forças recrutadas pelo governo, forças constituída por 3 mil homens. Registaram revoltas em Ermera, no tempo do governador Olavo Monteiro Torres (1848-1851). Depois de uma rebelião por parte de moradores de Ermera, governo mandou uma força de 6.000 homens que arrasou Ermera e matou o liurai e 60 dos seus súbditos. Houve revoltas em Balibó.
A perda dos territórios de Flores e Solor: Até 1859, Portugal detinha a maior parte do território na ilha de Timor, e nas ilha de Flores, os portugueses podiam contar com a lealdade dos reinos de Sica, Noumba, Larantuca, e Maubese. Dois reinos em Ombai (Alor) e Loblem. Em 1814, as ilhas de Pantar e de Adonara reconheciam igualmente a suserania portuguesas.
Em 1847, o governador Julião da Silva Vieira envolveu numa disputa com o governador e residente de Kupang sobre actos alegadamente cometidos pelo régulo de Oe-Cusse, território que os holandeses consideravam seus. Para resolver o problema da soberania nestas ilhas, o governador-geral holandês em Batavia mandou um representante a Díli ( D.Styem Parvé), em Março de 1848, a fim de negociar sobre este assunto. O governador Julião Silveira respondeu "considerar portugueses todos os territórios que tinham a bandeira portuguesa e holandeses os que arvorassem a holandesa". Mas, embora ordenando ao régulo de Oe-cusse que mantivesse a sua posição, o próprio governador concedeu a posse das ilhas em disputa aos Países Baixos, aguardando a conclusão de um acordo na Europa. Em 1850, o Ministério dos Negócios Estrangeiros dos Países Baixos transmitiu uma nota ao seu equivalente português insistindo na necessidade de resolver o problema das fronteiras. No ano seguinte foram nomeados comissários por ambas as partes tendo em vista o início das conversações. A 23 de Junho de 1851 chega a Timor o novo governador, José Joaquim Lopes de Lima. Perante dificuldade de ordem financeira, o novo governador entregou aos Holandeses o distrito de Larantuca, na ilha de Flores, juntamente com o grupo de ilhas de Solor. (Portugal foi obrigado a ceder aos Países Baixos enclaves na parte leste da Ilha de Flores, como Sica, e Paga, bem como a ilha de Adonara e o estado de Wure e a ilha de Solor. Portugal abandonou também as suas pretensões a Loblem, Pantar e Ombai, pondo assim termo a uma soberania de 300 anos naquelas terras. Em contrapartida, Portugal receberia 200.00 florins de indemnização, em três prestações, e receberia o reino de Maubara Enquanto se aguardava a assinatura de acordos entre os dois governos (Haia e Lisboa), a Holanda apressou-se a ocupar Larantuca e Solor. Lopes de Lima foi demitido e mandado regressar. Morreu a caminha da Batavia. Influencia portuguesa em Larantuca: a Confraria de Nossa Senhora do Rosário.
Do período que vai de 1860 a 1912, sucederam-se várias revoltas contra a soberania portuguesa em Timor. Após o tratado de Lisboa, a colónia de Timor foi dividida em dez distritos pelo governador Afonso de Castro. Com esta finalidade, foram estabelecidos, dez e depois onze comandos militares para gerirem os distritos, assessorados por um secretário. Como embrião doa actual sistema político administrativo de Timor-Leste, estes comandos centravam-se, respectivamente, em Díli, Manatuto, Viqueque, Lautém, Vemasse, Alas, Bubusucu, Maubara e Batugadé. Mais tarde foi adicionado Oe-cusse (1863). No tempo de Afonso de castro, os liurais receberam ordens para plantar café e entregar cerca de 20 por cento da colheita às autoridades portuguesas, Os reinos que não cultivavam café eram obrigado a entregar um décimo da sua colheita de arroz. (Gunn, p.176 - 177). Em 1861 após a entrada em vigor do estabelecimento dos distritos, pequenos reinos revoltaram-se, como era o caso de Ulmera e Lalcó. Em Junho de 1863, deu-se uma rebelião em Laga. Mais tarde foi a vez de Fatumassi. Em 1867 deram-se revoltas em Vemasse, Leimean e Sanirin, cujo reino se recusava a pagar os impostos. Em 1868 deu-se a revolta de Cova. Além das guerras, houve um incêndio em Díli, no dia 24 de Agosto de 1866. Esse incêndio consumira os quartéis, a igreja, o paiol de munições, a Fazenda Pública, o palácio do governo, e quinze propriedades privadas, na sua maioria construídas em palapa. O fogo destruiu também o que restava dos arquivos que restavam da época de Lifau. (Gunn, p. 139-140). Nessa altura funcionava em Díli, um hospital militar. Doenças de varíola, epidemias de cólera e de varíola. Segundo o governador António Joaquim Garcia (1868-1869), o hospital existente podia apenas acomodar uns poucos doentes e a sua higiene era precária.
O Plano do Porto de Díli, uma planta de 90 x 40 produzido por T. Andrea e T. Machado em 1870, revela que se fazia a recuperação da praça de Díli. "Nessa altura estava completado o estudo hidrógrafico do porto e o ancoradouro estava terminado, e que estava protegido por um forte chamado Carqueto. A grelha das ruas é bem visível, bem como os contornos do forte de Nossa senhora da Conceição. Estavam sinalizados um farol. Um hospital militar e uma ponte, baptizado com o nome de Dom Luís I.
Em 1788, em deu-se, a revolta dos moradores, com o consequente assassinato do governador Alfredo de Lacerda e Maia (1885-1887). Os moradores, eram timorenses nativos mobilizados para o recrutamento. Não recebiam salário ou uniforme, nem sequer lhes eram fornecidos mantimentos. Eram recrutados nos reinos leais em números proporcionais às respectivas populações. As razões parecem ter sido os excessos cometidos em nome do governador pelo secretário, Francisco Ferreira. No dizer do historiador francês Gabriel Defert o assassínio do governador Lacerda Maia marcou na realidade o início da insurreição dirigida conjuntamente por diversos liurais chefiados por Do, Duarte Sotomayor e seu filho, Dom Boaventura Em 1893, deu-se a revolta de Maubara. Sotomayor, de Manufahi.
Em 1894 é nomeado governador de Timor, José Celestino da Silva. Ficou célebre pelas campanhas de pacificação, pois vários estavam revoltados: Encetou três ofensivas principais: em Outubro de 1894, contra os reinos de Lamaquitos (Bobonaro); em Maço de 1895, contra Fatumane, Fohorem, Lalaba, Cassabau, Obulo e Marobo, e a mais dura conta Manufahi. Nesse mesmo ano, os reis de Manuafai, Raimean e Suai reuniram vários sucos e povoações para um pacto de sangue. O reino de Manufai foi atacado em 1896, por foças leais ao governo. Nos primeiros anos do século XX, deram-se revoltas em Ainaro e Letefoho (1903), em Kelicai (1904), e novamente Manufahi (1907). Depois da implantação da República, deu-se a grande Revolta de Manufahi ( os timorenses chamam "funu Manufahi").
Manufahi (Maun fahae) era um reino com a sede em Same e fazia parte do distrito de Alas, de acordo com a nova organização de 1860. Segundo Rafael da Dores, em 1903, esse reino tinha uma população de 42 mil habitantes e 6.500 fogos.
Em 11 de Outubro de 1911, reuniram em Díli os régulos e outros chefes dos sucos a convite do Governador para celebrarem o primeiro aniversário da proclamação da república. Nesta ocasião alguns deles fizeram secretamente um pacto de sangue a fim de expulsarem os portugueses. Nos finais de 1911, como reacção a uma informação transmita pelo comandante de Suai, anunciando o aumento de imposto de capitação, um grupo de liurais, incluído Dom Boaventura, de Same, procurou reunir-se em Suai para pedir a redução fiscal. Tomou-se a decisão de expulsar uma companhia inglesa que ali fazia a exploração de minas de petróleo obrigado a saída dos prospectores ingleses. Um soldado moçambicano que ia levar a notícia a Bobonaro foi morto durante a viagem. No dia 20 de Dezembro, o liurai de Camansa acompanhado de 1.200 pessoas entram no enclave holandês de Maucatar e pedem a protecção holandesa contra a represália português. No dia 24 do mesmo mês em Same cinco europeus foram mortos na sede do comando militar de Same, por ordem de Boaventura. Foi morto o Tenente Álvares da Silva, e a sua cabeça foi apresentada à sua mulher. Esta e os filhos foram poupados e remetido a Díli. Perante estes factos o governador Filomeno da Câmara organiza expedições contra Manufahi e reinos sublevados. Para esmagar a rebelião o governador ordenou que os rebeldes fossem batidos nas suas próprias terras. A 5 de Janeiro de 1912, partia de Díli uma força de 200 homens comandados pelo próprio Filomeno da Câmara. Alguns reinos apoiaram as forças governamentais como foi o caso de Suro A campanha militar prossegue até Março. Em 6 de Fevereiro chega a Díli a canhoneira Pátria. A 27 e Maio, os "rebeldes" preparam uma resistência heróica nas montanhas de Cablac (2.362 m), uma região de ravinas abruptas e grande rochedos. Aí os timorenses construíram uma tranqueira de madeira e pedra para reforçar a fortaleza natural. Alguns rebeldes procuraram refúgios em caves e grutas subterrâneas. Encurralados numa área de 35 km2, nos redutos de Riac e Leolaku, juraram combater até ao fim e não se render. No reinos rebeldes, mais de 12 mil homens, mulheres e crianças se haviam retirado para as montanhas de Leo-Laco. Nesta altura Filomeno da Câmara dispôs os seus efectivos: 8.000 auxiliares irregulares, 647 soldados de segunda linha e 500 soldados de primeira linha e 34 oficiais. Da parte do povo de Same e reinos Dispondo de maior numero de soldados, as forças governamentais alcançaram vitórias sobre os reinos de Umboe, na Ermera, e de Lelai em Lequidoe. Seguidamente foram submetidos os reinos de Manucate, Laquedoe, Hato-Bessi, Mau-Lau Dailor, Turiscai, Bibisusu e Mabisse. E Aituto. Leo-Laco foi cercado e mais de 3000 timorenses foram mortos quando tentavam romper o cerco. Em 27 de Maio de 1912, Kablak rendia-se. E, 22 de Junho, as forças governamentais conquistam Riac, onde foram feitos oito a dez mil prisioneiros e apreendidas 36 espingardas, 590 espingardas de pederneira e 495 espadas, além de alguns cartuchos. O Liurai Dom Boaventura conseguiu escapar, fugindo para Turron, mas o régulo de Alas caiu varado na planície de Ai-Assa. Os régulos de Bibisussu (Dom Afonso Pereira), de Ulmera (Dom Clementino Barreto Pereira) de Ermera, Dom Miguel, e outros, foram desapossados das honrarias. Em 26 de Outubro de 1912, D. Boaventura decidiu entregar-se voluntariamente. No ano de 1913, o regulo de Manufai perdeu o seu estatuto de "Rei-coronel". Reza a tradição oral que D. Boaventura acabou os seus dias na prisão de Aipelo, cerca de 20 km de Díli, e que foi enterrado na porta do cemitério de Santa Cruz para ser pisado por todos os transeuntes. Em Agosto, The Times de Londres dava a noticia sobre o fim do conflito em Timor. Dizendo que uma grande batalha entre forças colónias e rebeldes, e de resultaram 3000 mortos e feridos e 4.000 prisioneiros. Porém Pelissier conclui que a guerra de Manufahi (1911-1912) custou 15.000 e 25.000 mortes, sem contar aqueles que foram para o exílio (refugiaram-se no Timor indonésio).
O período que decorre entre 1913 e 1940 foram anos de sossego e de colonização. "Período de aparente tranquilidade e de trabalho tranquilo" A Sociedade Agrícola Pátria e Trabalho (SAPT), criada por Celestino da Silva em 1897 implementa a plantação e a exportação de café. Foram concedidos hectares de terrenos a individuais portugueses. O sândalo, a copra, cere e cacau eram produtos de exportação nesse período. Em 941, a SAPT era o único grande empreendimento agrícola a operara em Timor. Monopolizava as compras do café Arábica de melhor qualidade produzida em Timor. Exercia o monopólio do comércio entre Timor e o Japão e entre Timor e Portugal. Plantações de coqueiros, borracha e cana-de- açúcar e algodão. No campo de minerais, fazia a prospecção do petróleo, de cromite, manganésio, cobre e ouro. As primeiras companhias foram a companhia australiana e inglesa.
A Invasão estrangeira: Australianos, Holandeses e Japoneses.
No dia 17 de Dezembro de 1941 as tropas holandesas e australiana desembarcam em Díli à força. Cerca de meia noite de 19 de Fevereiro de 1942, navios japoneses bombardearam e as suas tropas desembarcaram num local chamado Madoi, a oeste da cidade. Dali marcharam sobre a capital, que ficava a cinco milhas de distância. Os holandeses retiraram para a fronteira e os Australianos para a região de Ermera, onde se entregaram à luta de guerrilha.
Os motivos do Japão para invadir Timor foram dados a conhecer pela primeira vez à população de Díli em panfletos largados sobre a cidade em 21 de Fevereiro de 1942, um após o ataque naval e terrestre contra Timor Português. Esses panfletos declaravam que o Japão estava agora em guerra com os Países Baixos e com a Austrália e que as forças japonesas eram obrigadas a actuar em resposta à presença das forças holandesas "num país neutral".
Em Maio de 1942, os australianos começaram a bombardear a capital de Timor; os japoneses apressaram-se a demolir a catedral, sob o pretexto de que as suas torres serviam de guia aos aviões inimigos. O governador Capitão Manuel Ferreira de Carvalho não tinha liberdade movimento, ficando praticamente prisioneiro no seu palácio. Os japoneses ocuparam o território de Timor desde 1942 até 1945. Em Setembro de 1975, deu-se o armistício. Balanço da ocupação japonesa: todas as igrejas destruídas, salvando-se a de Laleia; morreram neste conflito mais de 60 mil timorenses, entre quais 4 mil católicos e 3 sacerdotes. Díli sofreu 94 bombardeamentos aéreos, ficando apenas 10 casas de pé. Várias povoações haviam desaparecido; hospitais, postos sanitários, escolas e quartéis, foi tudo arrasado, apenas se salvou o hospital de Díli. As vias de comunicação e o porto, destruídos; a pecuária desaparecera praticamente; as ricas plantações de café abandonadas. Noventa por cento dos habitantes estavam sarnosos e mais de cinquenta por cento sofriam de pústulas bubáticas. No dia 27 de Setembro de 1945, chegaram a Timor os avisos Bartolomeu Dias e Gonçalves Zarco com o pessoal para a reocupação e levando material para a reconstrução de alguns edifícios governamentais. Com o governador Óscar Ruas, começou a faina da reconstrução. Mas o período de paz só durar 14 anos. Em Junho de 1959 deu-se a revolta de Viqueque, a qual se estendeu a Watolari e Watocarbau. Esta revolta foi imediatamente afogada. Segue-se outro período de acalmia: 1960 a 1975.
De acordo com a Constituição Política Portuguesa, a Lei Orgânica do Ultramar e o Esatatuto Político Administrativo, aprovado pelo Decreto nº 45 378, de 2 de Novembro de 1963, Timor Português era considerado uma província ultramarina com administração própria. No seu topo estava o governador, abaixo deste os administradores do concelho e os administrador do posto, e abaixo destes, os chefes dos sucos e de povoação. Existiam na Província os seguintes serviços:
A) Da Administração Geral e Fiscalização que englobava: Serviço de Administração vicial, Serviços de Educação, Organização Nacional da Mocidade Portuguesa, Polícia Internacional e de Defesa do Estado, Corpo de Polícia Pública, Serviços de Saúde e Assistência;
B) Serviços de Fazenda e Contabilidade; Serviços da Alfandega;
C) de Justiça;
D) De Fomento- Serviços de Economia, de Obras Públicas, de Agricultura e Florestas, de Veterinária, de Correios, Telégrafos e Telefones, de Aeronática Civil, de Transportes Aéreos, Serviços Meteorológico, e Centro de Informação e Turismo.
A divisão da colónia em nove concelhos (anterior à guerra japonesa) foi alterada e criaram-se dez concelhos, uma circunscrição civil, com 60 postos administrativos e uma Câmara municipal (Díli). 1. Concelho de Díli, com sede em Díli e Postos Administrativos de Aileu, Ataúro e Remexio.
2. Concelho de Ainaro, com sede em Ainaro, e Postos administrativos de Maubisse, Hato-Builico, Turiscai.
3. Concelho de Baucau, com sede em Vila Salazar, e Postos Administrativos de Quelicai, Venilale, Baguia, Laga e Vemasse.
4. Concelho de Bobonaro, com a sede na Maliana, e Postos Administrativos de Balibó, Bobonaro, Atabai, Cailaco e Lolotoi.
5. Concelho de Cova-Lima, com sede em Suai, e Postos Administrativos de Fatu-mean, Fohorém, Fatu-lulik, Mape e Tilomar.
6. Concelho de Ermera, com a sede em Ermera, e Postos Administrativos de Lautem, com a sede em Lospalos e Postos Administrativos de Luro, Iliomar, Lautém e Tututala.
7, Concelho de liquiçá, com a sede em Liquiçá, com Postos Administrativos de Maubara e Bazartete.
8. Concelho de Manatuto, com a sede em Manatuto, com os Postos Administrativos de Laclubar, Barique, Lacló, e Laleia.
9. Concelho de Same, com a sede em Same, e Postos Administrativos de Alas, Fatu-berliu e Hato-Udo.
10. Concelho de Viqueque, com a sede em Viqueque e Postos Administrativos de Ossu, Watolari, Watocarbau, Lacluta.
11. Circunscrição de Oe-Cusse, com a sede em Pante Macássar, com os Postos Administrativos de Oe-Silo, Nitibe e Pasabe. Em 1970, duas freguesias foram criadas, designadas por freguesia de Santo António de Motael e freguesia de Santo António de Baucau.
A nível militar, depois dos acontecimentos de Viqueque (1959), foram criadas as companhias de Caçadores e a polícia militar. Criou-se ainda uma delegação polícia política portuguesa – a PIDE. A nível de infra-estruturas, iniciou-se a electrificação de uma parte da cidade de Díli e realizou-se o alcatroamento das ruas principais da capital. Os quadros médios administrativos até aí estritamente reservados, em grande parte, aos metropolitanos, goeses ou cabo-verdianos, começavam a ser "compartilhados" por timorenses saídos do Seminário de Dare ou do Liceu de Díli.
Alguns Serviços, no período 1960-1975:
Ensino Primário: Coube à ordem dominicana (século XVIII) e às Missões Católicas (Diocese de Macau e o Vicariato de Timor) (1877-1940)a honra da fundação das primeiras escolas em Timor. Já em 1740, era aberto o primeiro Seminário em Oe-Kusse; em 1747, abria-se o segundo Seminário em Manatuto. Com a inclusão das Missões de Timor na Diocese de Macau, a partir de 1877, os missionários foram abrindo escolas nas sedes das Missões: Díli, Manatuto, Baucau, Oe-Cusse, Maubara, Lacluta, Soibada. No tempo do Bispo Dom António Joaquim Medeiros, o padre João Gomes, mais tarde Superior e Vigário das Missões de Timor, abria em Díli uma escola Profissional. O mesmo Bispo abria em Dare uma granja agrícola. Em 1924, Dom José da Costa Nunes, Bispo de Macau e Timor, abria em Lahane a Escola de Preparação de Professores- catequistas, e reabriu a escola de Artes e Ofícios, entregue aos Salesianos em 1927. Em 1936, o então superior da Missão de Soibada, padre Jaime Garcia Goulart, mais tarde 1º Bispo de Díli, abria na Missão de Soibada, o Pré-Seminário de nossa Senhora de Fátima, mais tarde erecto em Seminário Menor (1954). Em 1964, os Salesianos abriam em Fatumaca a Escola Agrícola de e depois a Escola Técnica. As Irmãs canossianas que entraram em Timor 1879, tomaram conta das escolas femininas em Díli, Bidau,(Dare), Manatuto, Soibada.Os Padre jesuítas, a Escola de Soibada (1899-1910).
Da Parte do Governo: A escola régia fundada em 1860, por Afonso de Castro. Em 1864, essa escola era frequentada por 6º alunos, com um professor destacado por nomeação real (cf. Gunn, p. 138). Outra escola em Manatuto, era frequentada por 20 alunos, ensinados por um missionário goês. O comandante do forte de Batugadé dava também educação a 15 alunos, naquela localidade. Fora ainda estabelecido em Díli um colégio de Educação para os filhos dos régulos.
Em 1916, o Governador Filomeno da Câmara, com a publicação, da Portaria Legislativa nº 154 deu uma planificação bem definida e maior planificação regulamentação ao ensino então ministrado em Timor. Outros governadores publicaram proposta ou diploma legislativo: Teófilo Duarte, em 1927, com a Proposta Legislativa nº 110; Álvaro de Fontoura, com o diploma Legislativo nº 154, em 1938.
Depois da ocupação japonesa, houve a necessidade de regulamentar de novo o ensino, o qual foi objecto do Diploma Legislativo nº 254. Todavia o primeiro grande passo no sentido de possibilitar a matrícula escolar a um muito maior número de crianças timorenses, dispersas pelo interior da Província, foi dado no princípio da década de 1960, por diploma de 1961do governador Themudo Barata, ao criar os postos escolares a cargo das Comissões municipais. Assim no ano lectivo de 1960/61, no território havia 6.076 alunos matriculados e 239 agentes de ensino, já no ano de 1968/69, havia 27 299 alunos matriculados e 513 agentes de ensino.
Ensino Liceal (a cargo do governo). Com o carácter de ensino particular liceal oficializado foi, em 1938, instituído o Colégio Liceu Dr. Vieira Machado. Mas só em 1952, é que se pode considerar autenticamente oficial com a criação do 1º ciclo. Foi a partir de então que nele se puderam realizar, com validade oficial, os exames de admissão, os de 1º e 2º ciclo, e ao mesmo tempo foi autorizado o ensino das disciplinas do 2º ciclo liceal. Data de 1960º então Liceu Dr. Francisco Machado. No ano lectivo de 1960/61, havia 175alunos matriculados e 15 agentes de ensino; em 1968/69, havia 376 alunos matriculados.
Ensino Técnico: Foi só a partir de 1967, é que se abriu o ensino técnico profissional, na "Escola Técnica Elementar Prof. Silva Cunha", mais tarde transformada na "Escola Industria e Comercial". N ano seguinte, a Escola teve uma frequência de 333 alunos, 1969.
O ensino elementar agrícola, instituído de acordo com o Decreto nº 46.464, de 31 de Julho de 1965 e regulamentado, em Timor, pelo Diploma Legislativo nº 740, de 26 de Novembro de 1966, foi entregue por contrato de Novembro de 1967, à Congregação salesiana. A escola era em Fatumaca (Banewaga).
Enfermagem: Junto do Hospital Central de Díli, vinham funcionando, desde 1947, escolas de habilitação de enfermeiros, parteiras pessoal auxiliar de enfermagem. Em 1964, em consequência da publicação do Decreto nº 45 818, foi criada a Escola Técnica de Serviços de Saúde e Assistência, com o urso geral de enfermagem e de auxiliar de enfermagem, e naquele ano tinha uma frequência de 58 alunos.
SAÚDE E ASSITÊNCIA- O primeiro Hospital de que há noticia, foi aberto em Lifau, no tempo do Governador António Coelho Guerreiro (1702-1702). Com a mudança da capital de Lifau para Díli, em 1769, foi naturalmente, construído em Díli, um hospital.
Em 1861, Alred Russel Wallace que estava visitar Timor observou: "Díli, rodeada de pântanos e lamaçais, é muito insalubre e só uma noite passada dá frequentemente aos recém-chegados uma febre que não pouca vezes se mostra fatal"(in The Malay Archipelago, Londres, 1872, Chap XII). No tempo do governador José Manuel Pereira de Almeida (1863-1864) foi concluído o hospital Castro-Lahane (Gunn. P.139). Um médico formado em Goa foi nomeado para prestar assistência ao Batalhão, mas não sabemos se havia médico para o hospital. Uma fonte oficial de 1868 dizia que as febres e a disenteria se haviam espalhado para o interior da Ilha e que as chuvas sazonais haviam piorado a situação na província. Em 1883 foi nomeado para Díli um oficial médico com a missão de dirigir a secção timorense dos serviços de Saúde de Macau e Timor. Era o dr. Gomes da Silva que encontrou no hospital várias lacunas nas estruturas de saúde publica. Em 1906, foi inaugurado em Lahane um edifício para hospital militar, ao qual foi dado o nome de "Hospital D. Carlos I", mais tarde mudado para "Hospital Dr. Carvalho", em homenagem a um médico falecido em Timor, vítima da sua dedicação. Em 1915 havia três médicos em Díli, os quais visitavam o interior alternadamente. Em 1918, com a criação de Serviços de saúde, foi a rede sanitária alargada a Baucau, Manufahi e Bobonaro, ao mesmo tempo que pelo interior se espalhavam ambulância com enfermeiros recrutados nos diversos comandos militares e habilitados com cursos de enfermagem. Antes da invasão das tropas estrangeiras (1941), havia em Timor 3 hospitais dos Serviços de Saúde, 1 hospital particular, 1 maternidade, 19 postos sanitários e 1 posto de socorros, dispondo, ao todo, de 5 médicos e 42 enfermeiros. Depois da guerra japonesa e sobretudo, a partir de 1948, foram construídos ou reparados os hospitais de Baucau e Ainaro, as maternidades de Díli e de Baucau e os postos sanitários d Lospalos, Laclubar, Aileu, Same, Lautém, Oe-Silo, Ossu e Venilale. Em 1970, a rede sanitária de Timor Português era constituída pelo Hospital Central de Díli e Regional de Díli, o Hospital Sub-regional de Baucau e 8 hospitais rurais e 48 postos sanitários rurais, nas sedes dos postos administrativos. Os postos sanitários rurais tinham, no mínimo, uma capacidade para 20 a 30 camas, para doentes de ambos os sexos.
Actividade económica: Agricultura e florestas; Pecuária e Pesca; Indústria e Energia, Comunicações.
Timor no Período 1975-1999.
Com a Revolução dos cravos de 24 de Abril de 1974, surgem e Timor Português as primeiras organizações políticas. O primeiro grupo a organizar-se foi a União Democrática Timorense, ou UDT. Fundada a 11 de Maio de 1974, a UDT, era favorável a uma eventual independência de corrente de um extenso período de transição em continuada associação com Portugal. A Fretilin, ou Frente Revolucionária de Timor Leste Independente, emergia da Associação Democrática Timorense (ASDT) fundada a 20 de Maio de 1974.O primeiro manifesta da ASDT rejeitava o colonialismo a reclamava a imediata participação dos timorenses na administração e governos locais, um fim à discriminação racial, a luta contra a corrupção e um bom relacionamento com os países vizinhos. A 27 de Maio de 1974, surgia um terceiro partido minoritário, a Associação Popular Democrática Timorense (Apodeti). Este partido declarou desde o início que não seria economicamente viável a menos que posse apoiado pelos seus irmão étnicos na Indonésia. Outros partidos: KOTA- Klibur Oan Timor Aswain, inicialmente formado por sete Liurais. O Partido Trabalhista e Adilta (Associação Democrática para Integração na Austrália).
Convém nota a posição oficial portuguesa que foi transmita pelo governador Fernando Alves Aldeia, sob três formas de opções: primeira, manutenção da associação com Portugal; segunda, independência; terceira, integração na Indonésia. Entretanto, a indonésia, por intermédio do jornal do Exército Berita Yudah, e de outros canais, começou a lançar campanha de difamação e desinformação apelidando a Fretilin de marxista/comunista e a UDT de fascista. A 14 de Novembro de 1974 o Coronel Mário Lemos Pires, foi nomeado governador de Timor, o qual pautava a sua atitude como árbitro entre os partidos em conflito. A partir de Dezembro de 1974, com a chegada os oficiais do MFA em Timor estabeleceram um conselho governativo com o propósito de chamar todos os partidos ao processo político. Houve logo recusas da parte de Apodeti e da Fretili. Em Março de 1975, a UDT e a Fretilin decidem formar uma Coligação. A 27 de Maio, a UDT toma a decisão de se retirar da coligação. A 17 de Julho de 1975, Lisboa estabeleceu o calendário da descolonização de Timor de acordo com a Lei n. 7 175. Formalmente anunciada como "cimeira", efectuou-se em Macau uma reunião entre os funcionários portugueses e indonésio, e membros dos partidos timorenses a excepção da Fretilin.
A 11 de Agosto de 1975, a UDT desencadeia o golpe de estado provocando o contra-golpe da Fretilin, iniciando-se assim guerra civil. Rapidamente a Fretilin conquista posições deixadas pelas forças conjuntas da UDT e estabelece uma administração, ainda sob a bandeira portuguesa. A 28 de Novembro de 1975, o Presidente da Fretilin, Francisco Xavier do Amaral, proclamou, unilateralmente a independência de Timor e a criação da república Democrática de Timor Leste. Conforme Xavier do Amaral comunicou por telegrama a Lisboa, no dia seguinte, esta medida era necessária devido à "agressão" da Indonésia, que violava as leis da ONU sobre o direito à autodeterminação e independência, e ao "desinteresse" do governo português em procurar uma solução concreta para a descolonização.". Um dia após a Fretilin ter proclamado unilateralmente a independência, os quatro partidos (UDT, Apodeti, Kota e o Partido Trabalhista) proclamaram a integração de Timor na Indonésia. Esta declaração conhecida pela "Declaração Balibó" (Proclamasi Balibó) serviu de pretexto à Indonésia para invadir Timor Leste, facto que veio a verificar-se no dia 7 de Dezembro de 1975. Conquistado o território de Timor-Leste, o governo de Jakarta estabelece um governo Provisório e uma Assembleia Legislativa (DPRD). Com a Lei nº 711.976, de 17 de Julho de 1976, o Presidente Soeharto declara a formalização da integração de Timor Português na República unitária da Indonésia e a criação da 27 ª Província de "Timor Timur". Em Junho a Novembro de 1978, as Forças Armadas Indonésias lançaram uma operação contra os guerrilheiros com o fim de aniquilar o inimigo, usando bombas e napalm . Em Dezembro desse mesmo ano, O Presidente da Fretilin, que substituíra Xavier do Amaral (capturado), foi morto em Turiscai. Em Março de 1981, os guerrilheiros escolheram Xanana Gusmão para chefe das Falintil e criaram o CNRM (Conselho Nacional de Resistência Maubere). Em Junho, deu-se a Operasi Keamanan, cujo objectivo era destruir a resistência e capturar os líderes dos guerrilheiros. Em 1983, Xanana e oficiais indonésios começaram a negociar tréguas locais (acordo entre Xanana e Coronel Purwanto. O cessar fogo, durou pouco, pois o General Moerdani , comandante-chefe das Forças Armadas Indonésias, organiza uma nova operação, Operasi Persatuan, destinada a atingir a resistência "sem piedade" e no decurso da qual quinze dos vinte batalhões estacionados em Timor, foram enviados para a zona leste da Ilha, com o objectivo de capturar Xanana Gusmão e outros comandantes. Em 12 de Outubro o papa João Paulo II visita Timor. Em 1991, deu-se o massacre de Santa Cruz, que fez amais de 241 vítimas. Em Novembro de 1992, o Comandante Xanana Gusmão é capturado. Em Fevereiro de 1993, o tribunal indonésio emitiu a sentença de prisão perpétua, mais tarde comutada para vinte anos de prisão em Jakarta. Em 1996, foi a concessão do Prémio Nobel da Paz. Em Abril de 2008, realizou em Peniche realizou uma convenção destinada a reforçar a unidade e a delinear uma visão para o futuro em torno de uma Magna Carta de Timor Leste. Nessa convenção os timorenses da Diáspora bem como os do interior, elegeram Xanana Gusmão e Ramos-Horta como presidente e vice-presidente do Conselho Nacional da resistência Timorense (CNRT). Entretanto, em Maio desse ocorreram em Jacarta dramáticos acontecimentos que levaram à demissão do presidente Soeharto e conduzira à eleição do seu sucessor Yusuf B. J. Habibbie. Em Junho o presidente indonésio fez uma proposta de ampla autonomia para Timor Timur. Porém em Janeiro de 1999, o presidente surpreendeu a todos ao fazer saber que se os Timorenses rejeitasse a "autonomia" dentro da Indonésia, então Timor Leste poderia voltar ao estatuto anterior a 1975, e ou Portugal ou a ONU deveriam reiniciar o processo da descolonização. Em Maio de 1999, sob os auspícios das Nações Unidas Portugal e Indonésia concordam a realização de uma Consulta Popular em Timor. O plebiscito realizou-se a 30 de Agosto de 1999. A maioria do povo timorense escolheu a opção de não autonomia dentro da Indonésia Os que rejeitaram a autonomia: 78,5 %, e os que votaram a favor da autonomia, 21,5%. Mais uma vez deflagrou a violência causando divisão entre a sociedade timorenses. Muitos foram procurar refúgio para o território indonésio, outros saíram para Austrália, Macau e Portugal. Foi então que as nações Unidas decidem enviar para o Território De 1999 a 2002, Timor era administrado pelas Nações unidas (UNTAET). Diziam os responsáveis (Sérgio Vieira de Melo) que as nações Unidas estavam em Timor para prepara o povo para as eleições e para independência e não para fazer o desenvolvimento.
No ano 2000, reuniu pela primeira vez a Assembleia Constituinte para preparar nova Constituição da República Democrática de Timor Leste. Em 2001, realizou a eleição do primeiro Presidente da República, na pessoa do Comandante e guerrilheiro Kairala Xanana Gusmão. No 20 de Maio de 2002, foi oficializada a Independência segundo o Direito Internacional. Nesse dia tome posse o primeiro Governo Constitucional. Infelizmente, em Dezembro de 2002, surgem de novo os conflitos, registando com incêndios de casas em Díli. A crise mais grave surgiu em 2006, em consequência das manifestações dos assim chamados "Peticionários". Depois de uma manifestação de quase vinte três semanas organizadas pela Igreja e pelos partidos da oposição, demite-se o primeiro Governo Constitucional liderado por Mari Alkatiri. Entretanto o Governo da Indonésia e da República de Timor-Leste, através da Comissão da Amizade e Verdade promovem esforços de reconciliação e de paz. A 11 de Fevereiro de 2008, deu-se o atentado contra o Presidente da República e contra o Primeiro-Ministro e concomitantemente, regista-se a morte do Major Alfredo Reinado, e mais tarde a rendição de vários peticionários.
Hoje, o ambiente geral é de calma, mas o trabalho da paz e da reconciliação continua a ser fundamental para um verdadeiro desenvolvimento do Povo Timorense.
Bibliografia:
1) Alerto Faria de Morais, Solor e Timor, Agência Geral das Colónias,Lisboa, 1944.
2) Geoffrey Gunn, Timor Loro Sae, 500 Anos, Livro do Oriente, Macau, 1999.
3) "Timor. Pequena Monografia, Agência Geral do Ultramar, 1970.
